三好層に含まれる礫の多くは、「チャート」でできています。チャートは硬い堆積岩ですが、角が取れて丸くなっているので、河川によって運ばれてきたものと考えられています。チャートは、赤、緑、黒などさまざまな色をした岩石です。三好層が堆積した後、(4)約12万年前の温暖期（リスーウルム間氷期）に、このあたりまでが亜熱帯気候になりました。高温多湿の気候で風化作用を受け、チャート礫は表面から白くなりました。三好層でできた丘陵も表層から風化作用を受け、赤褐色になりました（赤色土壌化）。このようにして、現在見られる三好層の特徴ができあがりました。